يعتبر الهدف الأول لوحدة مكافحة العدوى هو تطوير وتعزيز ممارسات مكافحة العدوى المهنية من خلال إعداد القواعد الأساسية والسياسات والإجراءات الواجب اتباعها داخل مباني مستشفى طب الأسنان الجامعي استنادا إلى مراجع ودراسات علمية معتمدة، والإشراف على تنفيذها،

وكذلك التعليم والتثقيف المستمر للطاقم الطبي وأعضاء هيئة التدريس والطلاب والمتدربين والعاملين، وخلق بيئة تحفز إشراك الجميع بالعملية التشريعية والتنفيذية، بالإضافة للمراقبة والتقييم المستمر لعملية التطبيق ورصد الممارسات الخاطئة.